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稻瘟病是如何被預(yù)警的?基因定位確定“抗病英雄”身份

  • 來源:互聯(lián)網(wǎng)
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  • 2019-09-30
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  前沿·聚焦

  稻瘟病是如何被預(yù)警的

  有進攻就有防御,植物界的戰(zhàn)爭和人類戰(zhàn)爭一樣,水稻在億萬年的進化中積累了豐富的作戰(zhàn)經(jīng)驗。它是怎么激發(fā)自身免疫系統(tǒng)開始戰(zhàn)斗的?面對稻瘟病菌重兵壓境,誰是哨兵?發(fā)現(xiàn)敵情后,它們?nèi)绾蝹鬟f軍事情報抵抗侵略的?水稻是用什么戰(zhàn)術(shù)作戰(zhàn)的呢?

  在經(jīng)歷了8年的深入研究后,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)萬建民院士團隊通過突變體鑒定、遺傳分析和基因定位等方法,成功克隆出調(diào)控水稻先天免疫的新基因OsCNGC9,揭示了該基因影響水稻苗期稻瘟病抗性的分子機制,發(fā)現(xiàn)了水稻依靠鈣離子通道激發(fā)自身免疫系統(tǒng)抵抗稻瘟的內(nèi)在本質(zhì),揭開了水稻大戰(zhàn)稻瘟的神秘面紗。日前,相關(guān)研究成果在線發(fā)表在國際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊Cell Research(《細胞研究》)。

  選美專家選了個丑家伙

  當看到8株水稻葉子出現(xiàn)了褐色的壞死斑點,就像老年斑一樣,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)副研究員劉喜皺了皺眉頭,“被丑到了”。作為育種專家,他是在選美,喜歡“桿青籽黃”長得好看的水稻,這幾株肯定是要淘汰的。

  他沒想到,這8株像染了稻瘟病的病秧子如同袁隆平發(fā)現(xiàn)的那幾株野水稻,會成為他目前最重要的科研發(fā)現(xiàn),開啟了水稻研究領(lǐng)域的一個新里程碑。

  那是2011年3月的一天,他在海南育種基地檢閱他手下那10多萬兵——10多萬株水稻,當時這8株水稻正在抽穗。像農(nóng)民一樣,劉喜臉被曬得黑黑的,為了加快育種進度,他像候鳥一樣,冬天在海南,夏天在南京培育水稻。

  劉喜在海南種了10多畝的水稻,他的水稻材料太多了,有三四千份不同種類的育種材料,一份材料種40株秧苗,每天要在田間觀察、拍照、記錄。他記得每一株水稻的名字編號和模樣,每株水稻他每月至少巡視4遍。

  這8株本就不算什么,三四千份稻種最終只能有幾個品種被選中,繁殖推廣。

  幾天后,他又看到了這8株丑家伙。“老年斑”在擴散,并且長勢也很差,個子有點矮。他決定再等段時間再觀察看看。

  一個月過去了,這8株丑家伙的“老年斑”雖然在繼續(xù)擴大,但它們并沒有死去,還跟其他正常水稻一樣結(jié)了果實,雖然略顯瘦小。

  到底是什么原因讓這8株水稻長得如此之丑?看著丑家伙旁邊俊俏的同伴們,劉喜陷入了深思并開始重點關(guān)注它們。到了收獲時,他單獨收獲了這8株丑家伙,拿回南京繼續(xù)種。

  在南京種植這一代,丑家伙丑得不明顯。劉喜沒灰心,看來這家伙是個單眼皮一樣的隱性基因控制。他決定繼續(xù)種,看看丑家伙到底是個什么樣。

  又連續(xù)種了兩代,在連續(xù)的自交純合后,丑家伙的“丑樣”終于穩(wěn)定遺傳下來了,連續(xù)出現(xiàn)了“老年斑”等特征,和第一代一樣,雖然很丑,但也都能活下來,并能繁育后代。

  2013年年初,劉喜把它作為一個新的突變體材料向萬建民院士做了匯報。萬建民院士決定作為一個項目開始研究。

  基因定位確定抗病英雄的身份

  這個項目交給了一個23歲的毛頭小伙子王家昌,當時他在南京農(nóng)業(yè)大學(xué)讀碩士。指導(dǎo)老師王益華教授告訴他,這個項目做下去畢業(yè)沒問題,但是能有什么樣的發(fā)現(xiàn)就看你自己了。

  王家昌也沒料想到這個項目能出大成果。他當時的打算是,只要博士能順利畢業(yè)找份不錯的工作就行。

  拿到這份特殊的水稻材料,王家昌開始運用遺傳學(xué)、分子生物學(xué)手段對它進行細致的分析。

  從田間生長的表現(xiàn)來看,丑家伙開始變丑是發(fā)生在水稻抽穗后——在小時候,丑家伙也不丑,跟正常水稻一樣。

  通過遺傳學(xué)分析,劉喜發(fā)現(xiàn)丑家伙和正常同伴雜交的第二代,有1/4出現(xiàn)了丑家伙的表型。根據(jù)孟德爾遺傳定律判斷,控制丑家伙“丑樣”的是一個隱性遺傳基因,這與劉喜之前的猜測一樣。

  先做基因定位。王家昌和劉喜把這個丑家伙的12條染色體與正常的品種對比,分段逐個篩查,看看到底是哪一個基因發(fā)生了突變。

  科研工作非常枯燥乏味。水稻基因有3萬多個,王家昌和劉喜根據(jù)染色體的門牌號——分子標記,終于在第九條染色體上找到了長相不一樣的染色體片段。

  拿到這個片段后,兩人開始入戶摸排,進行基因測序,找這個隱藏很深的導(dǎo)致丑家伙“丑樣”的幕后兇手。

  他們利用生物化學(xué)方法分析發(fā)現(xiàn),原來是丑家伙的一個正常基因被嚴重損壞了,喪失了功能!根據(jù)這個正常基因的特點,按照生物學(xué)界的起名規(guī)律,他們給這個基因起了個名字——OsCNGC9(簡稱阿九)。

  生物體中,離子通道就像一個城門,有專人值守,各種各樣的離子都可以通過專用通道去往它們想去的地方。他們發(fā)現(xiàn),鈣離子比較喜歡走阿九值守的這座城門。

  王家昌有點迷茫:鈣離子、阿九與丑家伙的種種“丑樣”之間有什么關(guān)系?該向哪個方向研究呢?他開始查閱各種文獻資料。在兩年內(nèi),他一直在摸索:是什么影響了水稻的育性?或者導(dǎo)致了水稻的衰老?還有可能影響了它的株高性狀?“老年斑”、個子矮、子孫少等表型性狀之間到底有什么關(guān)系呢?

  兩年過去了,關(guān)注的幾個研究方向均沒有得到很好的結(jié)果,王家昌很焦慮。2015年下半年,他閱讀文獻時發(fā)現(xiàn),植物抗病過程中會有大量的鈣離子到細胞中傳遞防御信息,鈣離子是公認的第二信使(第一信使是植物激素——記者注),但“通訊兵”鈣離子是從哪個通道進來一直是植物抗病領(lǐng)域的科學(xué)家們所好奇的。

  這個丑家伙身上的“老年斑”是很多重要免疫基因行駛功能的表現(xiàn)特征。是阿九影響了情報傳遞嗎?難道就是它在值守鈣離子通道嗎?

  稻瘟病是水稻的癌癥,受到攻擊的水稻傷亡慘重,輕則減產(chǎn)20%,重則顆粒無收。農(nóng)業(yè)部的數(shù)據(jù)顯示,近年來,稻瘟病每年給我國造成30億公斤以上的糧食損失,全球每年損失的糧食可供6000萬人吃一年。

  當他提出稻瘟病的研究方向時,導(dǎo)師萬院士很感興趣,給他提了一些建議,支持他繼續(xù)研究。結(jié)合多年的田間觀察,劉喜也支持這個方向。

  王家昌首先分析阿九是否有稻瘟病的抗病性。為了避免“老年斑”等其他因素對稻瘟病抗性分析的影響,他們選擇了對還沒變丑的丑家伙進行抗性分析,發(fā)現(xiàn)它抗病性很差,免疫力低下,阿九和鈣離子關(guān)系密切。

  抗病英雄的英雄壯舉

  需要研究的是:阿九值守的“城門”到底是不是鈣離子的專用通道?確定這一結(jié)論需要在動物細胞里進行電生理學(xué)實驗。一個跨學(xué)科的研究問題擺在了他們面前,王家昌一直研究植物,突然轉(zhuǎn)入動物學(xué)領(lǐng)域,感覺一下抓瞎了。

  這時,中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所為他提供了幫助,把阿九轉(zhuǎn)化到人胚腎細胞中:如果阿九值守的是鈣離子通道,那么在細胞內(nèi)外施加電壓后,就會有明顯的由鈣離子形成的電流。

  實驗結(jié)果正如所料,當施加電壓到-200 mV時,電流值達到了-100 pA,確認了阿九是鈣離子專用通道。

  在植物抗病過程中,鈣離子是否也走這條通道呢?經(jīng)過一系列的生理生化實驗分析發(fā)現(xiàn),由于阿九“犧牲”了,沒人開啟城門,鈣離子通道喪失功能,“通訊兵”鈣離子不能入城傳遞軍情,導(dǎo)致城內(nèi)防御松懈,無人應(yīng)戰(zhàn)。研究者發(fā)現(xiàn),丑家伙的其他免疫指標低于正常水稻。這表明阿九就是值守專用軍事情報通道“情報官”,他們給它起個正式名字——環(huán)核苷酸離子通道9。

  此時又有一個疑問出現(xiàn)在了他們的腦海中,“通訊兵”鈣離子入城傳遞軍情,是誰去向“情報官”阿九報告,讓“通訊兵”鈣離子順利地入城集結(jié),拉響警報啟動免疫反應(yīng)呢?通過一系列的生化實驗,他們發(fā)現(xiàn)了另一個調(diào)控抗病反應(yīng)的基因OsRLCK185(簡稱“阿五”),當“哨兵”阿五發(fā)現(xiàn)了外敵入侵的信號后,趕緊匯報給“情報官”阿九,阿九打開“城門”,讓“通訊兵”鈣離子到細胞中集結(jié),水稻中樞啟動免疫反應(yīng),增強水稻抗病性。

  一場戰(zhàn)斗過程逐漸在研究者的腦海里形成。在水稻和稻瘟病菌作戰(zhàn)中,“情報官”阿九起了至關(guān)重要的作用。文章通訊作者萬建民院士給記者打了個生動的比喻,這一系列的過程猶如一場“攻防戰(zhàn)斗”。此前研究者們只是看到了“通訊兵”,對于之前的“情報官”和“哨兵”如何發(fā)揮作用知之甚少。

  這個實驗開辟了一個新的研究領(lǐng)域,通過新基因發(fā)現(xiàn)了鈣離子通道,這是一條從病原識別到鈣通道激活的免疫信號傳導(dǎo)途徑,揭示了新基因(OsCNGC9)在鈣離子升高和水稻抗病中的作用,為水稻抗稻瘟病育種提供了重要的材料和理論基礎(chǔ)。

  為了研究抗病英雄阿九是否能夠有改良水稻稻瘟病抗性的潛力。研究者們采用轉(zhuǎn)基因等方法進行了驗證。把抗病英雄阿九轉(zhuǎn)移到正常水稻品種中觀察抗病性的變化。

  “實際上就是在水稻細胞中多增加了一部分抗病基因,相當于多增加幾條專用軍情傳遞通道。”王家昌解釋說。

  下一步就是讓包含新基因的細胞繼續(xù)分化,培育成稻苗,對稻苗接種稻瘟病菌,觀察它的成長變化。實驗驗證成功,新基因能顯著提高水稻抗病性,數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析差異極顯著。

  萬建民院士的助手江玲教授介紹說,這個項目跨學(xué)科跨平臺,得到了中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所、中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所、中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所等科研單位共同支持。

  科學(xué)界對“鈣離子通道”研究成果高度關(guān)注。萬建民認為,這項成果為水稻抗稻瘟病育種提供了重要的材料和理論基礎(chǔ)。

  文章共同第一作者、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)王家昌博士告訴記者,他將繼續(xù)研究鈣離子通道在植物里的功能,“這個項目讓我改變了人生規(guī)劃。”

  中國青年報·中國青年網(wǎng)記者 李潤文 通訊員 許天穎

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